- Caretaker (Tümör suppressörlerin alt grubudur): DNA hasralarını tamir eder, tamir edilemeyece hücreleri uzaklaştırır.Hasarlar çeşitli tümörlere dönüşebilir:
Beta-catenin
Katenin** kelimesinin etimolojisi (β-katenin veya CTNNB1’de olduğu gibi) hücre biyolojisindeki işlevsel ve yapısal rollerinden kaynaklanmaktadır:
Katenin:
- Latince “zincir ‘ veya ’bağlantı ‘ anlamına gelen ’catena ” kelimesinden türetilmiştir.
- Bu, proteinin cadherinleri (transmembran proteinleri) hücre içindeki aktin hücre iskeletine bağlamadaki rolünü yansıtır.
Beta (β):
- Yunan harfi “β ”, β-katenin’i katenin ailesinin diğer üyelerinden (örn. α-katenin, γ-katenin) ayırmak için kullanılır.
CTNNB1 (Gen Sembolü):
- CTNN: “Katenin “in kısaltması.
- B1: Catenin’in beta izoformunu ve catenin protein ailesi içindeki sınıflandırmasını belirtir.
Böylece, β-katenin adı, kaderin-katenin kompleksinde bir bağlayıcı protein olarak rolünü ve katenin protein ailesi içindeki yerini vurgular.
Genellikle beta-katenin (β-katenin) olarak adlandırılan Catenin (cadherin-associated protein), beta 1 (CTNNB1), hücre adezyonu ve gen transkripsiyon regülasyonunda kritik rolleri olan çok işlevli önemli bir proteindir. CTNNB1 geni** (HGNC ID: HGNC:2514) tarafından kodlanır ve yaklaşık 88 kDa moleküler ağırlığa sahiptir.
Moleküler Yapı ve Özellikler
- Protein Sınıfı: β-katenin, katenin ailesine aittir ve adherens bağlantı kompleksinin bir bileşeni ve Wnt sinyal yolunda bir transkripsiyon koaktivatörü olarak işlev görür.
- Yapısı:
- Bir N-terminal bölgesi, merkezi bir armadillo tekrar alanı ve bir C-terminal alanından oluşur.
- Armadillo tekrar alanı, protein-protein etkileşimlerini sağlayan süper helikal bir yapı oluşturan 12 tandem tekrardan oluşur.
- N-terminal bölgesi, β-katenin’i degradasyon için etiketleyen fosforilasyon ile düzenleme için kritik öneme sahiptir.
- C-terminal alanı transkripsiyonel koaktivatörlerle etkileşimi kolaylaştırır.
Fonksiyonlar
1. Hücre-Hücre Yapışması
- β-katenin, hücre-hücre yapışmasına aracılık eden cadherin-catenin kompleksinin önemli bir bileşenidir:
- Hücre içi alanda E-cadherin’e bağlanır ve onu α-catenin aracılığıyla aktin hücre iskeletine bağlar.
- Epitel dokularında hücreler arası bağlantıları stabilize ederek doku bütünlüğünü ve mimarisini korur.
2. Gen Transkripsiyonu Düzenlemesi
- β-katenin, embriyogenez, hücre çoğalması ve farklılaşması için çok önemli olan kanonik Wnt sinyal yolunun temel bir efektörüdür:
- Wnt sinyalinin yokluğunda, β-katenin yıkım kompleksi (APC, Axin, GSK-3β ve CK1’den oluşur) tarafından fosforilasyon yoluyla proteazomal yıkım için hedeflenir.
- Wnt sinyali aktif olduğunda, yıkım kompleksi inhibe edilir ve β-katenin’in birikmesine ve çekirdeğe translokasyonuna izin verir.
- Çekirdekte β-katenin, MYC, CCND1 ve AXIN2 gibi Wnt hedef genlerini etkinleştirmek için TCF/LEF transkripsiyon faktörleri ile etkileşime girer.

β-Catenin’in düzenlenmesi
1. Bozunma Yolu
- β-katenin stabilitesi, GSK-3β ve CK1 tarafından N-terminal Ser/Thr kalıntılarındaki fosforilasyon ile sıkı bir şekilde düzenlenir.
- Fosforile β-katenin β-TrCP tarafından tanınarak ubikitinasyonuna ve proteazomal degradasyonuna yol açar.
2. Wnt Sinyali
- Wnt sinyalizasyonunun aktivasyonu GSK-3β aktivitesini inhibe ederek β-katenin seviyelerini stabilize eder ve gen transkripsiyonunda işlev görmesini sağlar.
3. Post-Translasyonel Modifikasyonlar
- β-katenin, lokalizasyonunu, stabilitesini ve aktivitesini düzenleyen çeşitli modifikasyonlara (örn. fosforilasyon, asetilasyon, ubikitinasyon) uğrar.
Klinik Önem
1. Kanser
- β-katenin sinyalizasyonu, *kolorektal kanser*, *hepatoselüler karsinom*, *göğüs kanseri* ve melanom dahil olmak üzere çeşitli kanserlerle ilişkilendirilmektedir:
- CTNNB1 genindeki mutasyonlar (örneğin, fosforilasyon bölgelerini kodlayan ekson 3’te) β-katenin stabilizasyonuna ve Wnt sinyalinin yapısal aktivasyonuna neden olur.
- Yıkım kompleksinde önemli bir düzenleyici olan APC fonksiyonunun kaybı da β-katenin birikimine ve tümörigeneze yol açar.
2. Gelişimsel Bozukluklar
- Düzensiz β-katenin aktivitesi, nöral tüp defektleri ve kraniyofasiyal malformasyonlar dahil olmak üzere gelişimsel anomalilerle ilişkilidir.
3. Fibrozis
- β-katenin, pulmoner, hepatik ve renal fibrozda görüldüğü gibi fibroblast aktivasyonunu ve hücre dışı matris üretimini teşvik ederek fibrotik hastalıklara katkıda bulunur.
4. Nörolojik Bozukluklar
- Ortaya çıkan kanıtlar, sinaptik plastisite ve hücre yapışmasındaki rolleri nedeniyle Alzheimer hastalığı gibi nörolojik durumlarda β-katenin düzensizliğini göstermektedir.
Terapötik Etkiler
- Kanserde β-Catenin’in Hedeflenmesi:
- β-katenin-TCF/LEF etkileşimlerini inhibe etmek veya yıkım kompleksini stabilize etmek için küçük moleküller ve peptitler geliştirilmektedir (örn. tankiraz inhibitörleri).
- Wnt Yolağı Modülasyonu:
- Wnt sinyalizasyonunun modüle edilmesi, özellikle kemik onarımı ve kök hücre aktivasyonunda rejeneratif tıp için araştırılmaktadır.
- İlaç Direnci:
- Düzensiz β-katenin kemoterapi ve hedefe yönelik tedavilerde dirence katkıda bulunarak ilaç direncinin üstesinden gelmek için kritik bir hedef haline gelir.
Araştırma ve Gelecek Yönelimleri
- β-katenin’in adezyon ve sinyalizasyondaki ikili rolü, özellikle bu işlevlerin nasıl koordine edildiğini anlamak için aktif bir araştırma alanı olmaya devam etmektedir.
- Metabolizma, bağışıklık ve enflamasyondaki rolleri de dahil olmak üzere β-katenin’in kanonik olmayan işlevleri üzerine araştırmalar devam etmektedir.
Keşif
1970’ler-1980’ler: Hücre Yapışma Moleküllerinin Erken Tanımlanması
- 1977: Kadherinler ilk olarak hücreler arası bağlantıların sürdürülmesi için çok önemli olan kalsiyum bağımlı yapışma molekülleri olarak tanımlandı.
- 1980s: Kateninler de dahil olmak üzere kaderinlerle ilişkili proteinler, adherens bağlantı kompleksinin bir parçası olarak tanımlandı.
1992: β-Katenin’in keşfi
- β-Catenin ilk olarak E-cadherin’e bağlanan ve onu α-catenin aracılığıyla hücre iskeletine bağlayan bir protein olarak izole edilmiştir. Bu, epitel hücrelerinin doku bütünlüğünü nasıl koruduğunu anlamada önemli bir bulguydu.
1990s: Wnt Sinyal Yolundaki Rolü
- 1993: β-Catenin, kanonik Wnt sinyal yolağında merkezi bir efektör olarak yer aldı ve hücre yapışması ve gen transkripsiyonundaki ikili rolünün anlaşılmasında bir değişime işaret etti.
- 1996: β-Catenin’in TCF/LEF transkripsiyon faktörleri ile etkileşime girerek hücre çoğalması ve farklılaşmasında rol oynayan genlerin ekspresyonunu düzenlediği gösterilmiştir.
1997-1998: Kanser Bağlantıları
- 1997: CTNNB1 genindeki** mutasyonlar kolorektal kanserlerde tanımlandı ve anormal β-katenin aktivitesine ve konstitütif Wnt sinyalizasyonuna yol açtı.
- 1998: β-katenin degradasyonunun önemli bir düzenleyicisi olan APC (adenomatöz polipozis koli) kaybının, ailesel adenomatöz polipozis (FAP) ve sporadik kanserlerde β-katenin birikimini ve tümörigenezi tetiklediği bulunmuştur.
2000s: Yapısal Anlayışlar
- 2000: β-katenin’in kristal yapıları armadillo tekrar alanını ortaya çıkararak kadherinler, TCF/LEF ve diğer proteinlerle nasıl etkileşime girdiğine dair bilgiler sağladı.
- 2005: Yapısal çalışmalar β-katenin’in fosforilasyon bölgelerini daha da detaylandırarak ubikitin-proteazom yolu ile parçalanmasını aydınlattı.
2010s: Gelişim ve Hastalıkta Genişletilmiş Roller
- 2010: β-Catenin’in kök hücre yenilenmesi ve farklılaşmasında rol oynadığı ve Wnt sinyalini doku rejenerasyonuna bağladığı bulundu.
- 2012: Düzensiz β-katenin fibrotik hastalıklarda ve Alzheimer hastalığı gibi nörodejeneratif bozukluklarda rol oynar.
- 2015: Araştırma, β-katenin’in kanserlerdeki ilaç direncine katılımını ve terapötik bir hedef olarak potansiyelini vurguladı.
2020s: Terapötik Gelişmeler
- 2020: Kanserlerde ve fibrotik hastalıklarda klinik çalışmalar için β-katenin etkileşimlerini veya Wnt sinyalindeki rolünü hedefleyen küçük moleküller geliştirilmiştir.
- Devam ediyor: β-Catenin, doku onarımını artırmak ve fibrozisi kontrol etmek için modülasyonunu araştıran çalışmalarla rejeneratif tıbbın odak noktası olmaya devam etmektedir.
İleri Okuma
- Kemler, R. (1992). Classical Cadherins. Annals of the New York Academy of Sciences, 676(1), 233–245.
- Rubinfeld, B., Souza, B., Albert, I., et al. (1993). Association of the APC Gene Product with β-Catenin. Science, 262(5140), 1731–1734.
- Aberle, H., Schwartz, H., Kemler, R. (1994). Single Amino Acid Substitutions in Proteins of the Armadillo Gene Family. Journal of Molecular Biology, 238(1), 78–88.
- Behrens, J., von Kries, J. P., Kuhl, M., et al. (1996). Functional Interaction of β-Catenin with the Transcription Factor LEF-1. Nature, 382(6592), 638–642.
- Korinek, V., Barker, N., Morin, P. J., et al. (1997). Constitutive Transcriptional Activation by a β-Catenin-Tcf Complex in APC−/− Colon Carcinoma. Science, 275(5307), 1784–1787.
- Polakis, P. (2000). Wnt Signaling and Cancer. Genes & Development, 14(15), 1837–1851.
- MacDonald, B. T., Tamai, K., & He, X. (2009). Wnt/β-Catenin Signaling: Components, Mechanisms, and Diseases. Developmental Cell, 17(1), 9–26.
- Clevers, H., & Nusse, R. (2012). Wnt/β-Catenin Signaling and Disease. Cell, 149(6), 1192–1205.
- Valenta, T., Hausmann, G., & Basler, K. (2012). The Many Faces and Functions of β-Catenin. The EMBO Journal, 31(12), 2714–2736.
- Xu, C., Fan, Z., Liang, Y., et al. (2020). Small Molecule Inhibitors of the Wnt/β-Catenin Signaling Pathway in Cancer Therapy. Oncology Letters, 20(1), 101.
Retinoblastoma protein
- Retinoblastom-Protein (pRb, Rb) bir tümör baskılıyıcı gen proteinidir.
- Birçok tümörde, fonksiyonu hasarlıdır.
p53
- Birçok hücrede, sayısız tipi gözlemlenen protein.

- DNA’nın hasarından dolayı aktif hale gelir ve p21‘in Expressyonunu uyarır.Böylelikle hücre döngüsü durur.
- Eğer Dna hasarı çok büyükse, p53 Bax ‘ın expressyonunu düzenler ve böylelikle apoptose işlemi gerçekleşir.
- ayrıca bakınız; Mutator Fenotip
- Hasarlı DNA ile çoğalan hücrelerin tedavisi için cytostatika kullanılır.Işın tedavisinin şuana kadar başarılı bir verisi bulunmamaktadır.
- Eşey yolunda p53 ün mutasyonu,: Li-Fraumeni-Syndromuna veya genotoksik etki(ışın, kimyasallar) altında kalır.
SMAD
- hücre içi bir preoteindir.
- TGF-ß ‘nın TGF-Rezeptörlerine ilettiği sinyali, hücre çekirdeğine iletir.Böylelikle çekirdekteki belirli bir geni etkileyerek, transkripsiyona başlar.
HER2/neu
Sinoniim: human epidermal growth factor receptor 2,
- Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2,erB2 veya CD340 (cluster of differentiation 340), proto-oncogene Neu, Erbb2 (kemirgen), veya ERBB2 (insan)
- ERBB2 geni tarafından kodlanan bir proteindir.
- Sıkça HER2 (human epidermal growth factor receptor 2) veya HER2/neu de denir.
Hem büyüme faktörü reseptörüne hem de kromozom 17 üzerindeki ilgili gene atıfta bulunulur.Tüm meme kanseri vakalarının% 20’sinde HER2 / neu geninde bir değişiklik ve karsinoma hücrelerinin hücre yüzeyinde ilişkili HER2 / neu reseptörünün aşırı ifadesi vardır. .

Klinik
- Her2 / neu’nun aşırı ekspresyonunun kanıtı, artan invazivlik, metastaz eğilimi ve meme kanserinin kemorezistansı ile ilişkilidir. Kanıtlanmış HER2 / neu mutasyonu olan meme kanseri hastalarında trastuzumab veya lapatinib gibi biyolojiklerin kullanımı prognozu geliştirir. Ara sıra HER2 / neu aşırı ekspresyonu diğer malignitelerde de gösterilmiştir; Örn; Özofagus karsinomlarında.
- (Fizyolojik) epidermal büyüme faktörü reseptörü: sinyal iletim yolları yoluyla hücre proliferasyonunun uyarılması, apoptozun inhibisyonu;
- (patolojik) onkogen; Aşırı ekspresyon veya gen amplifikasyonu u. A. Meme kanseri, yumurtalık kanseri, glioblastoma;
- (farmakolojik) monoklonal antikorlarla (trastuzumab, lapatinib) tedavi için hedef yapı.

APC
-
Adenomatous polyposis coli
- Activated protein C
Epidermal büyüme faktörü reseptörü
epidermal growth factor receptor (EGFR; ErbB-1; HER1 insanda) hücre yüzey rezeptörüdür. hücre dışı protein ligandlarının epidermal growth factor family (EGF-family) ailesinin üyelerini tanımak için özelleşmişti
- EGF reseptörü, EGF’nin bağlanması ile aktif hale gelip, hücre içinde bir dizi kimyasal tepkimeyi gerçekleştirir.Bu tepkimeler, hücrenin hayatta kalması için önemlidir.
- Tümör hücrelerinde ise, bu hayati yolların onkogen veya tümör baskılayıcı genler tarafından mutasyona uğramıştır.
- Büyüme faktörlerin fazla salınması; TGF-α’nin fazla salgılanmasından dolayı, hücre otokrin büyüme uyarısı ile hücre organizmadan bağımsız olarak uyarıp, gelişir.
- Reseptörlerin fazla olması; EGF moleküllerin reseptöre bağlanıp, sinyal yaratma olasılığını arttırır.Bu olay, akciğer ve bağırsak kanserinde sık rastlanır.
Eğer hücre fazla büyüme faktörüne ve reseptörüne sahipse, etkili bir otokrin büyüme uyarısı oluşur.
- erbB2 proteinin fazla salgılanması; Normal hücrelerde neredeyse hiç salgılanmaz.Örneğin göğüs kanserinde; erbB2’nin ligandı yoktur.Bu yüzden EGFR (=erbB1) ile Heterodimer oluşturur.
- Reseptör Moleküllerin mutasyona uğraması; Bu durumda, hücre kendini aktif edebilir.Mutasyonlu reseptör sayesinde aşırı gelişen hücreler, reseptörün engellenmesi durumunda büyümeleri durur.
- Ras genlerinin mutasyonu; Ras geninin 12. ve 13. kodonlarında oluşan nokta mutasyonları yüzünden, GTP’den GDP’e hidrolizini hücre gerçekleştiremiyor.Ras, insandaki dayanıklı tümörlerin en sık onkojenidir.Bu yüzden hastalara hücre içi sinyal yollarına müdahelede bulunabilmek için , ağır tedavi yöntemleri uygulanır.
- bcr-abl ‘dan oluşan füzyon proteini; Oluşan Kinaseler onkojen olarak aktifdir.Tedavi olarak Imatinib(GLIVEC®) = Kinase inhibitör kullanılır.
Değişiklik yapan beta büyüme etkeni
Sinonim: Transforming growth factor beta.(TGF-β)
- Değişiklik yapan büyüme etkenleri protein ailesine ait olan çok işlevli bir sitokindir. Aileye ait olan diğer izoformları şunlardır;
- TGF-β 1’den 3’e kadar,
- HGNC TGFB1,
- TGFB2,
- TGFB

Kaynak: http://www.sinobiological.com/styles/default/images/index_files/TGF-beta-Signaling.gif
TGF alpha
- Transforming growth factor alpha (TGF-α) TGFA geninin ürettiği bir proteindir.