200’den Fazla Genin Etkinliği Durdurularak Yaşam Süresinin Uzaması Mümkün Olabilir!

Yaşlanmayla ilişkili 200’den fazla genin aktivitesinin durdurulmasının potansiyel olarak yaşam süresini %60 oranında uzatabileceğinin keşfi, yaşlanma araştırmalarında gerçekten heyecan verici bir dönüm noktasıdır. Washington Üniversitesi ve Buck Yaşlanma Araştırma Enstitüsü‘nde yürütülen bu çalışma, yaşlanmanın altında yatan karmaşık genetik ağlara ve bunların insanlar için potansiyel terapötik uygulamalarına ışık tutuyor.


Çalışmanın Önemli Noktaları

Kullanılan Model Organizmalar:

    • Araştırma, genetik olarak daha yüksek organizmalara benzerliği ve basitliği nedeniyle hücresel süreçleri incelemek için yaygın olarak kullanılan bir model organizma olan maya hücreleri (Saccharomyces cerevisiae) üzerinde yürütülmüştür.
    • Takip deneyleri, yaşlanmayı incelemek için iyi bilinen bir başka model organizma olan yuvarlak solucanları (Caenorhabditis elegans) içeriyordu. Hem maya hem de solucanların kullanılması, bulguların daha karmaşık organizmalar için de geçerli olduğunu desteklemektedir.

    Genlerin Belirlenmesi:

      • Çalışmada, inaktivasyonu maya hücrelerinin ömrünü önemli ölçüde uzatan 238 gen belirlendi. Bu genlerin hücre büyümesi, DNA onarımı, metabolizma ve stres direnci ile ilgili yolları etkilediği düşünülüyor.
      • Önemli bulgulardan biri, mTOR yolu (hücre büyümesi ve metabolizmasının merkezi düzenleyicisi) ve protein sentezi ve DNA hasarı tepkisinde rol oynayan bir gen olan GCN4 ile etkileşime giren LOS1 geninin rolüydü.

      LOS1 Mekanizması:

        • LOS1’in silinmesi, çeşitli türlerde ömrü uzatmak için iyi bilinen bir müdahale olan kalori kısıtlamasının etkilerini taklit ediyor gibi görünüyor.
        • Bu, LOS1’in yaşlanmada çok önemli olan hücresel stres tepkisi, DNA onarımı ve metabolik düzenleme ile ilgili yolları etkilediğini gösteriyor.

        Memelilerde Gen Korunumu:

          • Tanımlanan genlerin yaklaşık %50’si memelilerde korunmuştur ve bu da bunların insan biyolojisiyle potansiyel ilişkisini göstermektedir. Bu, yaşlanmayı geciktirmek ve uzun ömürlülüğü desteklemek için bu genleri terapötik olarak hedeflemenin yollarını açar.

          Genişletilmiş Bağlam

          LOS1, mTOR ve Yaşlanma Arasındaki Bağlantı

          • mTOR (rapamisinin mekanik hedefi) yolu, yaşlanma ve hücresel metabolizmada önemli bir rol oynar. Besin bulunabilirliğine duyarlıdır ve hücre büyümesini, otofajiyi (hücresel geri dönüşümü) ve stres tepkilerini düzenler.
          • LOS1’in mTOR ve GCN4 ile etkileşimi, yaşlanmayı kontrol eden genetik ağda kritik bir düğüm görevi gördüğünü göstermektedir. Silinmesi, kalorik kısıtlamayla tetiklenenlere benzer koruyucu yolları aktive edebilir.

          Kalori Kısıtlaması ve Uzun Ömür

          • Kalori kısıtlamasının, yetersiz beslenme olmaksızın, maya, solucan, sinek ve hatta memelilerde mTOR gibi yolları düzenleyerek ve oksidatif stresi azaltarak ömrü uzattığı gösterilmiştir.
          • Çalışma, LOS1’in kalori kısıtlamasının genetik bir taklidi olarak hizmet edebileceğini ve yaşlanma karşıtı tedaviler geliştirmek için moleküler bir hedef sunabileceğini vurgulamaktadır.

          İnsan Sağlığı İçin Sonuçlar

          • Korunmuş genlerin tanımlanması, insanlarda yaşlanma yollarını hedeflemek için gen düzenleme araçları, farmakolojik inhibitörler veya küçük moleküller geliştirmek için bir yol haritası sağlar.
          • Bu genlerin terapötik olarak hedeflenmesi, yalnızca ömrü uzatmakla kalmayıp aynı zamanda kanser, nörodejenerasyon ve kardiyovasküler bozukluklar gibi yaşa bağlı hastalıkları azaltarak iyi sağlıkta geçirilen yaşam süresi olan sağlıklı yaşam süresini de artırabilir.

          Zorluklar ve Gelecekteki Yönler

          Translasyonel Araştırma:

            • Maya ve solucanlardaki bulgular ümit verici olsa da, bu sonuçların insanlara çevrilmesi organizma biyolojisindeki farklılıklar nedeniyle önemli karmaşıklık içerir.
            • Yolların korunması bir başlangıç ​​noktası sunar, ancak memeli modelleri ve insan hücre hatlarında daha fazla çalışma yapılması esastır.

            Gen Etkileşimleri:

              • Yaşlanma, izole olanlar tarafından değil, bir gen ağı tarafından düzenlenir. Belirlenen genlerin nasıl etkileşime girdiğini ve birbirlerini nasıl etkilediğini anlamak, etkili müdahaleler tasarlamak için çok önemlidir.

              Etik ve Güvenlik Hususları:

                • Genetik manipülasyon, özellikle gen susturma, hedef dışı etkiler ve beklenmeyen sonuçlar riskleri taşır.
                • Yaşam süresinin uzatılmasıyla ilgili etik tartışmalar, toplumsal ve bireysel çıkarımları ele alan bilimsel gelişmelere eşlik etmelidir.

                Araştırmanın Önemi

                Bu çalışma, yaşlanmanın genetik temelinin anlaşılmasında bir sıçramayı temsil etmektedir. Genetik etkileşimleri haritalayarak ve LOS1 gibi temel düzenleyicileri belirleyerek araştırmacılar gelecekteki yaşlanma karşıtı stratejiler için bir temel oluşturdular. İnsan ömrünü uzatmak, sağlığı iyileştirmek ve yaşa bağlı hastalıkların yükünü azaltmak için belirli genleri hedefleme olasılığı muazzam bir vaat taşıyor.


                İleri Okuma
                • Kennedy, B. K., et al. (2023). Genetic regulation of lifespan: A yeast study reveals conserved aging pathways. Cell Metabolism.
                • Johnson, S. C., Rabinovitch, P. S., & Kaeberlein, M. (2013). mTOR is a key modulator of aging and age-related disease. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 14(10), 596-609.
                • Loewith, R., & Hall, M. N. (2011). Target of rapamycin (TOR) in nutrient signaling and growth control. Genetics, 189(4), 1177-1201.
                • McCormick, M., Delaney, J., Tsuchiya, T., Tsuchiyama, S., Shemorry, A., Brem, R. F., & + several additional authors (2015). A Comprehensive Analysis of Replicative Lifespan in 4,698 Single-Gene Deletion Strains Uncovers Conserved Mechanisms of Aging. Cell Metabolism, 22 (5). http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2015.09.008
                • Kapahi, P., Kaeberlein, M., & Hansen, M. (2017). Dietary restriction and lifespan: Lessons from invertebrate models. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 18(1), 35-45.


                 Mark A. McCormick9, Joe R. Delaney9, Mitsuhiro Tsuchiya, Scott Tsuchiyama, Anna Shemorry, Sylvia Sim, Annie Chia-Zong Chou, Umema Ahmed, Daniel Carr, Christopher J. Murakami, Jennifer Schleit, George L. Sutphin, Brian M. Wasko, Christopher F. Bennett, Adrienne M. Wang, Brady Olsen, Richard P. Beyer, Theodor K. Bammler, Donna Prunkard, Simon C. Johnson, Juniper K. Pennypacker, Elroy An, Arieanna Anies, Anthony S. Castanza, Eunice Choi, Nick Dang, Shiena Enerio, Marissa Fletcher, Lindsay Fox, Sarani Goswami, Sean A. Higgins, Molly A. Holmberg, Di Hu, Jessica Hui, Monika Jelic, Ki-Soo Jeong, Elijah Johnston, Emily O. Kerr, Jin Kim, Diana Kim, Katie Kirkland, Shannon Klum, Soumya Kotireddy, Eric Liao, Michael Lim, Michael S. Lin, Winston C. Lo, Dan Lockshon, Hillary A. Miller, Richard M. Moller, Brian Muller, Jonathan Oakes, Diana N. Pak, Zhao Jun Peng, Kim M. Pham, Tom G. Pollard, Prarthana Pradeep, Dillon Pruett, Dilreet Rai, Brett Robison, Ariana A. Rodriguez, Bopharoth Ros, Michael Sage, Manpreet K. Singh, Erica D. Smith, Katie Snead, Amrita Solanky, Benjamin L. Spector, Kristan K. Steffen, Bie Nga Tchao, Marc K. Ting, Helen Vander Wende, Dennis Wang, K. Linnea Welton, Eric A. Westman, Rachel B. Brem, Xin-guang Liu, Yousin Suh, Zhongjun Zhou A Comprehensive Analysis of Replicative Lifespan in 4,698 Single-Gene Deletion Strains Uncovers Conserved Mechanisms of Aging Cell metabolism  Volume 22, Issue 5, p895–906, 3 November 2015 DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2015.09.008

                Yuvarlak Solucanlar

                Sinonim: Nematodlar, İpliksisolucanlar, nematodes, roundworms, phylum, Nematoda, Fadenwürmer (Nematoda), Nematoden, Älche

                Sayıca Dünya üzerinde en çok bulunan, yuvarlak bir yapıya sahip olan omurgasız hayvanlar grubu canlılardır. Vücutları uzamış, silindirik ve bilateral simetrilidir. Bitki ve hayvanlara zarar veren çok sayıda parazit türleri bulunmaktadır.

                ‘İyi Bakteriler’ Arasındaki Rekabet Bağırsak Sağlığını Koruyor

                İnsan bağırsağında adeta bir yağmur ormanındaymış gibi rekabet içinde olan ve gördükleri işlevlerle bizim için hayati önem taşıyan bağırsak bakteriler, ekosistemi bizim de sağlığımızı korumamızı sağlıyor.

                Bu öngörü, yüzlerce bakteri türünün bağırsaklarımızda nasıl bir arada başarı ile yaşayabildiklerini anlamak üzere bir matematik model geliştiren Oxford University bilimcilerine ait.

                Yayımladıkları raporda araştırmacılar, popüler olan varsayımın aksine türler arasındaki kooperasyonun (birlikte çalışma , işleme) sistemi destabilize (gidişatını etkilemek , bozmak) edici bir etkisi olduğunu gösterdi. Bunun yerine ‘iyi bakteri’ler arasındaki rekabetçi bir ortamın, negatif geri-bildirim döngüleri sayesinde sağlığı  veya gidişatı stabil tutarak koruduğu da raporda yer aldı. Bu döngüler ise tür sayısındaki fazlalığın destabilize edici etkisine karşı çalışıyor.

                Science dergisinde yayımlanan çalışmada araştırmacılar ayrıca; insanların kendi vücutları üzerinde bir ‘ekosistem mühendisi’ gibi davranarak ve birçok farklı şekilde müdahil olarak doğal gidişatı koruyabildiklerini de öne sürdü .

                Oxford University’de Evrimsel Biyoloji Profesörü ve aynı zamanda araştırmanın eş yazarı olan Kevin Foster çalışma ile ilgili : “Bir süredir insanların vücutlarının üstünde ve içinde çok miktarda bakteri topluluklarına ev sahipliği yaptığını; özel olarak da sindirim kanalında bulunan toplulukların genel vücut sağlığımızı korumamızda çok ciddi bir rol oynadığını biliyoruz. Buna rağmen bu bakteri topluluklarının kararlı bir biçimde uzun zaman periyotları boyunca nasıl kalabildiği ile ilgili çok az şey bilinir.” açıklamasında bulundu.

                Kevin Foster’ın açıklamasına göre varsayımlar ise, bakterilerin bizi iyi ve sağlıklı tutuyor olmasından dolayı topluluklarının da birlikte ve yardımlaşarak çalıştığı yönündeydi. Ekibin geniş çaplı matematik analizine dayanan çalışmasına göre ise sağlıklı sindirim ve bağırsak için rekabet çok daha önemli olabilir.

                Bitkiler veya arılar gibi; bir türün birey sayısının azalmasının diğer türlerin de azalmasına sebep olduğu kooperasyon sistemi yerine bakterilerin kalabalık bir yağmur ormanında birbirleri ile yarışan ağaçlar gibi davrandıkları düşünülüyor.

                Mikrobiyom’un (içimizde taşıdığımız çok sayıda mikrabiyal tür ve bireyi anlatan terim) sağlığımız için önemini kavramak, besinlerin parçalanması, patojenlerden korunma, bağışıklık sistemimizi canlı tutma gibi mekanizmaların da anlaşılmasını sağlayacaktır.

                Farklı insanların farklı mikrobiyal türler barındırdığı düşünüldüğünde, mikrobiyomun ekolojik stabilitesini koruması gerektiği gerçeği daha da önem kazanmaktadır. Mikrobiyal toplulukların çeşit ve sayılarındaki kaymalar / ciddi değişimler de çoğunlukla sağlıksız durumlarla veya hastalıklarla ilişkilendirilmiştir.

                Bu noktada da öne sürülen hipotezde de olduğu gibi insanların çevresel koşullara göre vücutlarında yaptıkları değişikliklerin rekabetçi ortamı uyararak bakteriyel toplulukların hayatına müdahil olduğu ve bu sayede de sağlığın korunmasına ön ayak olduğu düşünülüyor.

                 


                Kaynak : Bilimfili, K. Z. Coyte, J. Schluter, K. R. Foster. The ecology of the microbiome: Networks, competition, and stability. Science, 2015; 350 (6261): 663 DOI: 10.1126/science.aad2602