Asetilasyon

“Asetilasyon” terimi, bir metil grubuna (-CH3) bağlanmış bir karbonil grubundan (-C=O) oluşan organik bir fonksiyonel grubu ifade eden “asetil” kimyasal bileşiğinden türetilmiştir. “Asetil” kelimesi Latince sirke anlamına gelen “acetum” kelimesinden türetilmiştir. Bunun nedeni, sirkenin ana bileşeni olan asetik asidin bir asetil grubu kaynağı olmasıdır.

Asetilasyon kavramı uzun yıllardır bilinmekte ve üzerinde çalışılmaktadır. Asetilasyonla ilgili ilk araştırmalar 19. yüzyılın sonlarına, özellikle de organik kimya alanına kadar uzanmaktadır. Bu dönemde bilim insanları, asetil grupları ve bunların diğer moleküllerle reaksiyonları da dahil olmak üzere çeşitli bileşiklerin kimyasal özelliklerini araştırıyorlardı.

Biyokimya ve moleküler biyoloji alanında, asetilasyon çalışması 20. yüzyılın ortalarında histon asetilasyonunun keşfi ile önem kazandı. 1964 yılında bilim insanları, DNA paketlemesinde ve gen düzenlemesinde önemli bir rol oynayan histon proteinlerinin asetilasyon yoluyla değiştirilebileceğini keşfetti. Bu bulgu, asetilasyonun gen ifadesi ve kromatin yapısındaki rolüne ilişkin yeni araştırma yolları açtı.

O zamandan beri, çeşitli biyolojik süreçlerde asetilasyonun mekanizmalarını ve işlevlerini aydınlatmak için kapsamlı araştırmalar yapılmıştır. Histon asetiltransferazlar (HAT’lar) ve histon deasetilazlar (HDAC’lar) gibi asetil gruplarının eklenmesinden veya çıkarılmasından sorumlu enzimlerin tanımlanması, asetilasyonun düzenlenmesi ve hücresel fizyoloji ve hastalık üzerindeki etkisi hakkında bilgi sağlamıştır.

Günümüzde asetilasyon, gen regülasyonundan protein stabilitesi ve fonksiyonuna kadar çeşitli hücresel süreçlerde yer alan temel bir post-translasyonel modifikasyon olarak kabul edilmektedir. Asetilasyonun sağlık ve hastalıktaki kesin mekanizmalarını, işlevsel sonuçlarını ve terapötik etkilerini ortaya çıkarmak için devam eden çabalarla aktif bir araştırma alanı olmaya devam etmektedir.

Asetilasyon, bir moleküle bir asetil grubu (-COCH3) ekleme işlemini ifade eder. Çeşitli biyolojik süreçlerde meydana gelebilen yaygın bir kimyasal modifikasyondur. Asetilasyon, hücrelerde gen ifadesinin ve protein fonksiyonunun düzenlenmesinde önemli bir rol oynar.

Histon asetilasyonu bağlamında, histon proteinleri üzerindeki lizin kalıntılarına asetil gruplarının eklenmesi anlamına gelir. Histonlar, DNA’yı kromatin adı verilen kompakt bir yapı halinde paketlemeye ve düzenlemeye yardımcı olan proteinlerdir. Histonların asetilasyonu kromatin yapısını gevşeterek DNA’yı transkripsiyon faktörleri ve diğer düzenleyici proteinler için daha erişilebilir hale getirebilir. Bu süreç, genlerin daha kolay transkripsiyonuna izin verdiği için gen aktivasyonu ile ilişkilidir.

Asetilasyon, enzimler ve transkripsiyon faktörleri gibi diğer proteinlerin modifikasyonunda da meydana gelir. Protein fonksiyonunu, stabilitelerini, aktivitelerini veya diğer moleküllerle etkileşimlerini değiştirerek etkileyebilir. Asetilasyon, metabolizma, hücre döngüsü düzenlemesi ve DNA onarımı dahil olmak üzere çeşitli hücresel süreçleri etkileyerek hücreler içinde bir sinyal mekanizması olarak hizmet edebilir.

Asetil gruplarının eklenmesine veya çıkarılmasına sırasıyla asetiltransferazlar ve deasetilazlar adı verilen enzimler aracılık eder. Proteinlerin asetilasyon durumundaki dengesizlikler kanser, nörodejeneratif bozukluklar ve metabolik bozukluklar dahil olmak üzere çeşitli hastalıklarla ilişkilendirilmiştir. Bu nedenle, asetilasyonun düzenlenmesi ve işlevsel sonuçlarının anlaşılması biyomedikal araştırmalarda büyük ilgi görmektedir.

Özetle asetilasyon, asetil gruplarının moleküllere, özellikle de histonlara ve diğer proteinlere eklenmesini içeren biyolojik bir süreçtir. Gen ifadesinin düzenlenmesinde ve protein fonksiyonunda çok önemli bir rol oynar ve asetilasyonun düzensizliği hastalık gelişimine katkıda bulunabilir.

Click here to display content from YouTube.
Learn more in YouTube’s privacy policy.

Translasyon

Biyokimyada çeviri, mRNA (haberci RNA) tarafından taşınan genetik kodun spesifik bir protein üretmek üzere ribozom tarafından çözüldüğü karmaşık bir süreç olan protein biyosentezinin kritik bir aşamasıdır. Bu süreç, genlerin ifadesi ve ardından canlı organizmaların işleyişi için gereklidir. Ribozom, tamamlayıcı tRNA (transfer RNA) moleküllerinin mRNA’ya bağlanmasını indükleyerek kod çözmeyi kolaylaştırır. Kodonlardan (üç nükleotit dizileri) oluşan mRNA dizisi, amino asitlerin büyüyen polipeptit zincirine eklenme sırasını belirler ve sonuçta proteinin yapısını ve işlevini belirler.

Prokaryotlar ve ökaryotlar arasındaki çeviri sürecindeki temel ayrımlar şunları içerir:

  • Polisistronik ve Monosistronik mRNA: Prokaryotik mRNA sıklıkla polisistronik olarak adlandırılan birkaç farklı proteine ait bilgiyi içerirken ökaryotik mRNA tipik olarak yalnızca bir proteine ait bilgiyi taşır veya monosistroniktir.
  • Ribozom Bağlanma Bölgeleri: Prokaryotlar, tek bir mRNA molekülünden birden fazla proteinin eşzamanlı translasyonuna izin veren birden fazla ribozom bağlanma bölgesine sahiptir. Bunun tersine, ökaryotik ribozomlar genellikle tek bir bölgeye bağlanır.
  • Transkripsiyon ve Translasyonun Birleşmesi: Prokaryotlarda, mRNA’nın translasyonu, transkripsiyon tamamlanmadan önce başlayabilir; bu, nükleer membranın yokluğu ve bu süreçlerin sitozolde eşzamanlı olarak meydana gelmesiyle kolaylaştırılan bir olgudur. Ancak ökaryotik hücreler, çekirdek içindeki transkripsiyonu ve sitoplazmadaki translasyonu bölümlere ayırır, böylece bu süreçleri ayırır.

Biyokimyada çevirinin evrensel yönü, spesifik amino asitleri ve kodonları tanıyan, mRNA dizisinin gerektirdiği şekilde proteinlerin birleştirilmesini kolaylaştıran tRNA moleküllerinin kullanılmasında yatmaktadır. Amino asitler, adenosin kalıntısının hidroksil grubuna bir ester bağı ile tRNA’nın 3′ ucuna bağlanır ve ribozomun, bitişik amino asitler arasında peptit bağlarının oluşumunu katalize etmesini sağlar.

Biyomekanik

Biyomekanikte çeviri, belirli bir hareket türünü ifade eder. Vücudun tüm noktalarının aynı yönde ve aynı mesafe boyunca hareket ettiği bir nesnenin doğrusal veya öteleme hareketi ile karakterize edilir. Bu, vücudun farklı bölümlerinin merkezi bir eksen etrafında daireler halinde hareket ettiği dönme hareketinden farklıdır. Biyomekaniğin çevirisi, vücutların uzaydaki hareketlerini anlamak, onlara etki eden kuvvetleri ve momentleri analiz etmek ve bu bilgiyi yardımcı cihazların tasarımına, rehabilitasyon stratejilerine uygulamak ve atletik performansı geliştirmek için gereklidir.

İleri Okuma

  • Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., & Walter, P. (2002). Molecular Biology of the Cell. 4th edition. Garland Science.
  • Lodish, H., Berk, A., Zipursky, S. L., Matsudaira, P., Baltimore, D., & Darnell, J. (2000). Molecular Cell Biology. 4th edition. W. H. Freeman.
  • Nairn, R., & Helgason, C. D. (2015). Biochemistry and Cell Biology of Mammalian Translation. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, 7(10).
  • Enoka, R. M. (2008). Neuromechanics of Human Movement. 4th Edition. Human Kinetics.

Click here to display content from YouTube.
Learn more in YouTube’s privacy policy.